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TCMBank:最大的中药数据库介绍
图2. STTT文章页面 TCMBank是目前(发表文章时)规模最大、可免费下载的非商业中医药数据库。 TCMBank以mol2格式提供草药成分的3D结构,并提供与外部公共数据库的交叉引用链接,如CAS、DrugBank、PubChem、MeSH、OMIM、DO、ETCM、HERB等。

DrugBank数据库Downloads详解(版本5.1.4,2019-7-2)
可以发现这是一个被批准的药物(Approved drug),是蛋白质类型。 因此,Drug Sequences是 蛋白质类药物。 2. Protein identifiers(Approved) Protein identifiers include external IDs to resources such as UniProt and PDB. These downloads are divided first by protein/compound type (target, transporter, etc.). Secondly they are divided by drug group (approved ...

【生信实操】一文教会你查找基因的启动子以及预测转录因子 ...
前面我们介绍了可以帮助我们确定基因在何时、何地、何种条件下被激活的启动子,接下来我们来聊一下另一个同样重要的物质:🔑 转录因子。按照惯例,我们先来梳理一下概念:👇 转录因子Transcription Factors,TFs 转录因子能特异性地与基因的特定序列结合,通常长度在5至20bp之间,从而确保目标 ...

【知识讲解】分子生物学常用网站介绍 - DXY.cn
lUniprot UniProt整合了Swiss-Prot、 TrEMBL 和 PIR-PSD 三个数据库,主要优势在于添加了蛋白功能注释信息。 具有更新速度快、与其他数据库联系密切、分析工具齐全、使用便捷的特点,成为了目前信息最丰富、资源最广的蛋白质数据库。

中药研究怎么做?多靶点药物分子研究,网络药理学也能发 ...
随后利用UniProt数据库对所有靶点进行组合和鉴定,剔除重复的验证靶点和预测靶点。 最后通过Cytoscape软件构建活性成分靶点网络。 PubChem 有机小分子生物活性数据库 https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov (Kim et al, 2016) STITCH 化合物-蛋白相互作用数据库

为什么在uniprot中一个ID会对应到PDB数据库中的多个ID
这个帖子发布于 15 年零 24 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。 为什么在uniprot中一个ID会对应到PDB数据库中的多个ID? 那么PDB数据库的每个ID(对应同一uniprot)又有什么不同呢? 求教了。

关于uniprot.tsv
最近自学网络药理学,用的是之前网上下来的代码,其中有一步是用perl把基因的全名转化为基因的symbol,需要uniprot.tsv这个数据库文件,但是看了下文件是1年前的,求带佬指导一下这个数据库文

如何比对一个基因在不同物种间的同源性
如何比对一个基因在不同物种间的同源性一、在NCBI-Gene分别找到人源、鼠源的LOXL2(以人源的LOXL2为例子);二、随后进入https ...

protocol 分享|棕榈酰化修饰的检测——质谱分析
👉戳此收藏订阅棕榈酰化修饰的检测——质谱分析 👉戳此收藏订阅棕榈酰化修饰的检测——质谱分析 👉戳此收藏订阅棕榈酰化修饰的检测——质谱分析 简介 棕榈酰化修饰是一种重要的蛋白质修饰方式,指的是将棕榈酸酰化于蛋白质分子的赖氨酸残基上。 这种修饰方式在细胞信号传导、膜定位和 ...

【请教】免疫球蛋白IgG Fc的CDS区为什么不是从ATG开始的啊
免疫球蛋白IgG Fc(ensembl数据库)的CDS区为什么不是从ATG开始的啊,对应的蛋白质序列(Uniprot数据库)也不是从M氨基酸开始的,是本身序列不完全还是这个序列CH1前面还有编码区?

 

 

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